Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spcs3Q6ZWQ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spcs3Q6ZWQ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms