Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smpd4Q6ZPR5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smpd4Q6ZPR5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpd4Q6ZPR5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Smpd4Q6ZPR5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Smpd4Q6ZPR5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpd4Q6ZPR5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpd4Q6ZPR5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpd4Q6ZPR5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd4Q6ZPR5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpd4Q6ZPR5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd4Q6ZPR5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd4Q6ZPR5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpd4Q6ZPR5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpd4Q6ZPR5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms