Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPL9

Ddx55, ATP-dependent RNA helicase DDX55, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx55Q6ZPL9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx55Q6ZPL9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ddx55Q6ZPL9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx55Q6ZPL9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx55Q6ZPL9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx55Q6ZPL9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx55Q6ZPL9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx55Q6ZPL9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx55Q6ZPL9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx55Q6ZPL9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ddx55Q6ZPL9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ddx55Q6ZPL9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddx55Q6ZPL9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ddx55Q6ZPL9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx55Q6ZPL9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx55Q6ZPL9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx55Q6ZPL9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx55Q6ZPL9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx55Q6ZPL9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx55Q6ZPL9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx55Q6ZPL9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddx55Q6ZPL9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx55Q6ZPL9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx55Q6ZPL9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ddx55Q6ZPL9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ddx55Q6ZPL9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ddx55Q6ZPL9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx55Q6ZPL9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx55Q6ZPL9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx55Q6ZPL9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx55Q6ZPL9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms