Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Asic3Q6X1Y6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Asic3Q6X1Y6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Asic3Q6X1Y6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Asic3Q6X1Y6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms