Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn5Q6VZZ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn5Q6VZZ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Opn5Q6VZZ7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opn5Q6VZZ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opn5Q6VZZ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opn5Q6VZZ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opn5Q6VZZ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opn5Q6VZZ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn5Q6VZZ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn5Q6VZZ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn5Q6VZZ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opn5Q6VZZ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opn5Q6VZZ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Opn5Q6VZZ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opn5Q6VZZ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opn5Q6VZZ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opn5Q6VZZ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn5Q6VZZ7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn5Q6VZZ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn5Q6VZZ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn5Q6VZZ7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn5Q6VZZ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn5Q6VZZ7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opn5Q6VZZ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opn5Q6VZZ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opn5Q6VZZ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opn5Q6VZZ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opn5Q6VZZ7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opn5Q6VZZ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn5Q6VZZ7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn5Q6VZZ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Opn5Q6VZZ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Opn5Q6VZZ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Opn5Q6VZZ7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn5Q6VZZ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn5Q6VZZ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn5Q6VZZ7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn5Q6VZZ7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Opn5Q6VZZ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Opn5Q6VZZ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Opn5Q6VZZ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Opn5Q6VZZ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Opn5Q6VZZ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opn5Q6VZZ7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Opn5Q6VZZ7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Opn5Q6VZZ7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Opn5Q6VZZ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Opn5Q6VZZ7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Opn5Q6VZZ7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opn5Q6VZZ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opn5Q6VZZ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn5Q6VZZ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn5Q6VZZ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn5Q6VZZ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Opn5Q6VZZ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Opn5Q6VZZ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn5Q6VZZ7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn5Q6VZZ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn5Q6VZZ7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn5Q6VZZ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn5Q6VZZ7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn5Q6VZZ7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn5Q6VZZ7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn5Q6VZZ7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms