Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casc1Q6TDU8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Casc1Q6TDU8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Casc1Q6TDU8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Casc1Q6TDU8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Casc1Q6TDU8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Casc1Q6TDU8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Casc1Q6TDU8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Casc1Q6TDU8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Casc1Q6TDU8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Casc1Q6TDU8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Casc1Q6TDU8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Casc1Q6TDU8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Casc1Q6TDU8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Casc1Q6TDU8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Casc1Q6TDU8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Casc1Q6TDU8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Casc1Q6TDU8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Casc1Q6TDU8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Casc1Q6TDU8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Casc1Q6TDU8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Casc1Q6TDU8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Casc1Q6TDU8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Casc1Q6TDU8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Casc1Q6TDU8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms