Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpeQ6RT24 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpeQ6RT24 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpeQ6RT24 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpeQ6RT24 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpeQ6RT24 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpeQ6RT24 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpeQ6RT24 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpeQ6RT24 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpeQ6RT24 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpeQ6RT24 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpeQ6RT24 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpeQ6RT24 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpeQ6RT24 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpeQ6RT24 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpeQ6RT24 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpeQ6RT24 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpeQ6RT24 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpeQ6RT24 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpeQ6RT24 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms