Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc57Q6PHN1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc57Q6PHN1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc57Q6PHN1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc57Q6PHN1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc57Q6PHN1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc57Q6PHN1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc57Q6PHN1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc57Q6PHN1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc57Q6PHN1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc57Q6PHN1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc57Q6PHN1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc57Q6PHN1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc57Q6PHN1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc57Q6PHN1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc57Q6PHN1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc57Q6PHN1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms