Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rasa4Q6PFQ7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rasa4Q6PFQ7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rasa4Q6PFQ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rasa4Q6PFQ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rasa4Q6PFQ7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rasa4Q6PFQ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rasa4Q6PFQ7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rasa4Q6PFQ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rasa4Q6PFQ7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rasa4Q6PFQ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rasa4Q6PFQ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rasa4Q6PFQ7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rasa4Q6PFQ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rasa4Q6PFQ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rasa4Q6PFQ7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rasa4Q6PFQ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rasa4Q6PFQ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rasa4Q6PFQ7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rasa4Q6PFQ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rasa4Q6PFQ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rasa4Q6PFQ7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rasa4Q6PFQ7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rasa4Q6PFQ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rasa4Q6PFQ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rasa4Q6PFQ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rasa4Q6PFQ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rasa4Q6PFQ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rasa4Q6PFQ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rasa4Q6PFQ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rasa4Q6PFQ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rasa4Q6PFQ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rasa4Q6PFQ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rasa4Q6PFQ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rasa4Q6PFQ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rasa4Q6PFQ7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rasa4Q6PFQ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rasa4Q6PFQ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rasa4Q6PFQ7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rasa4Q6PFQ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rasa4Q6PFQ7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rasa4Q6PFQ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rasa4Q6PFQ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rasa4Q6PFQ7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasa4Q6PFQ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasa4Q6PFQ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rasa4Q6PFQ7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rasa4Q6PFQ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rasa4Q6PFQ7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rasa4Q6PFQ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rasa4Q6PFQ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rasa4Q6PFQ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rasa4Q6PFQ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rasa4Q6PFQ7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rasa4Q6PFQ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasa4Q6PFQ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasa4Q6PFQ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasa4Q6PFQ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasa4Q6PFQ7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasa4Q6PFQ7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasa4Q6PFQ7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasa4Q6PFQ7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rasa4Q6PFQ7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasa4Q6PFQ7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasa4Q6PFQ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rasa4Q6PFQ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasa4Q6PFQ7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasa4Q6PFQ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasa4Q6PFQ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasa4Q6PFQ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasa4Q6PFQ7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasa4Q6PFQ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasa4Q6PFQ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasa4Q6PFQ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasa4Q6PFQ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms