Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PdgfrlQ6PE55 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PdgfrlQ6PE55 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdgfrlQ6PE55 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdgfrlQ6PE55 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdgfrlQ6PE55 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdgfrlQ6PE55 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PdgfrlQ6PE55 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PdgfrlQ6PE55 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdgfrlQ6PE55 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdgfrlQ6PE55 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PdgfrlQ6PE55 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PdgfrlQ6PE55 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PdgfrlQ6PE55 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PdgfrlQ6PE55 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdgfrlQ6PE55 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdgfrlQ6PE55 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms