Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zbtb39Q6PDK0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zbtb39Q6PDK0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zbtb39Q6PDK0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zbtb39Q6PDK0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zbtb39Q6PDK0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zbtb39Q6PDK0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zbtb39Q6PDK0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbtb39Q6PDK0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbtb39Q6PDK0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zbtb39Q6PDK0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zbtb39Q6PDK0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Zbtb39Q6PDK0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zbtb39Q6PDK0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zbtb39Q6PDK0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zbtb39Q6PDK0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zbtb39Q6PDK0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zbtb39Q6PDK0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zbtb39Q6PDK0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zbtb39Q6PDK0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zbtb39Q6PDK0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zbtb39Q6PDK0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zbtb39Q6PDK0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zbtb39Q6PDK0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbtb39Q6PDK0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbtb39Q6PDK0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zbtb39Q6PDK0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zbtb39Q6PDK0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zbtb39Q6PDK0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zbtb39Q6PDK0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zbtb39Q6PDK0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zbtb39Q6PDK0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zbtb39Q6PDK0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zbtb39Q6PDK0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zbtb39Q6PDK0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zbtb39Q6PDK0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Zbtb39Q6PDK0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zbtb39Q6PDK0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zbtb39Q6PDK0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zbtb39Q6PDK0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zbtb39Q6PDK0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zbtb39Q6PDK0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zbtb39Q6PDK0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zbtb39Q6PDK0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zbtb39Q6PDK0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zbtb39Q6PDK0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zbtb39Q6PDK0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbtb39Q6PDK0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbtb39Q6PDK0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbtb39Q6PDK0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbtb39Q6PDK0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zbtb39Q6PDK0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zbtb39Q6PDK0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Zbtb39Q6PDK0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zbtb39Q6PDK0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Zbtb39Q6PDK0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zbtb39Q6PDK0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Zbtb39Q6PDK0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Zbtb39Q6PDK0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Zbtb39Q6PDK0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zbtb39Q6PDK0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zbtb39Q6PDK0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zbtb39Q6PDK0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zbtb39Q6PDK0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Zbtb39Q6PDK0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zbtb39Q6PDK0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zbtb39Q6PDK0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms