Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL7

Ahdc1, AT-hook DNA-binding motif-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ahdc1Q6PAL7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ahdc1Q6PAL7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ahdc1Q6PAL7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ahdc1Q6PAL7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ahdc1Q6PAL7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ahdc1Q6PAL7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ahdc1Q6PAL7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ahdc1Q6PAL7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Ahdc1Q6PAL7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Ahdc1Q6PAL7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ahdc1Q6PAL7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Ahdc1Q6PAL7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Ahdc1Q6PAL7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Ahdc1Q6PAL7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ahdc1Q6PAL7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ahdc1Q6PAL7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ahdc1Q6PAL7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ahdc1Q6PAL7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ahdc1Q6PAL7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ahdc1Q6PAL7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ahdc1Q6PAL7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ahdc1Q6PAL7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Ahdc1Q6PAL7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ahdc1Q6PAL7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ahdc1Q6PAL7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ahdc1Q6PAL7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ahdc1Q6PAL7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ahdc1Q6PAL7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Ahdc1Q6PAL7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Ahdc1Q6PAL7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Ahdc1Q6PAL7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ahdc1Q6PAL7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ahdc1Q6PAL7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ahdc1Q6PAL7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ahdc1Q6PAL7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ahdc1Q6PAL7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ahdc1Q6PAL7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ahdc1Q6PAL7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Ahdc1Q6PAL7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ahdc1Q6PAL7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ahdc1Q6PAL7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ahdc1Q6PAL7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ahdc1Q6PAL7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Ahdc1Q6PAL7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ahdc1Q6PAL7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ahdc1Q6PAL7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ahdc1Q6PAL7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ahdc1Q6PAL7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ahdc1Q6PAL7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ahdc1Q6PAL7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ahdc1Q6PAL7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ahdc1Q6PAL7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ahdc1Q6PAL7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ahdc1Q6PAL7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ahdc1Q6PAL7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ahdc1Q6PAL7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ahdc1Q6PAL7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ahdc1Q6PAL7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Ahdc1Q6PAL7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Ahdc1Q6PAL7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ahdc1Q6PAL7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ahdc1Q6PAL7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ahdc1Q6PAL7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ahdc1Q6PAL7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ahdc1Q6PAL7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ahdc1Q6PAL7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ahdc1Q6PAL7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ahdc1Q6PAL7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ahdc1Q6PAL7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ahdc1Q6PAL7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ahdc1Q6PAL7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Ahdc1Q6PAL7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ahdc1Q6PAL7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ahdc1Q6PAL7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ahdc1Q6PAL7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ahdc1Q6PAL7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ahdc1Q6PAL7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ahdc1Q6PAL7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ahdc1Q6PAL7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ahdc1Q6PAL7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ahdc1Q6PAL7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms