Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp200Q6P4T2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp200Q6P4T2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp200Q6P4T2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp200Q6P4T2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrnp200Q6P4T2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrnp200Q6P4T2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrnp200Q6P4T2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrnp200Q6P4T2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrnp200Q6P4T2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrnp200Q6P4T2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrnp200Q6P4T2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp200Q6P4T2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp200Q6P4T2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp200Q6P4T2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp200Q6P4T2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp200Q6P4T2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp200Q6P4T2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp200Q6P4T2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp200Q6P4T2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp200Q6P4T2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp200Q6P4T2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp200Q6P4T2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrnp200Q6P4T2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp200Q6P4T2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp200Q6P4T2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp200Q6P4T2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp200Q6P4T2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrnp200Q6P4T2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrnp200Q6P4T2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp200Q6P4T2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp200Q6P4T2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp200Q6P4T2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp200Q6P4T2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp200Q6P4T2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp200Q6P4T2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrnp200Q6P4T2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrnp200Q6P4T2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp200Q6P4T2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp200Q6P4T2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp200Q6P4T2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp200Q6P4T2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.6 ms