Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RbfaQ6P3B9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RbfaQ6P3B9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RbfaQ6P3B9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RbfaQ6P3B9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RbfaQ6P3B9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RbfaQ6P3B9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RbfaQ6P3B9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RbfaQ6P3B9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RbfaQ6P3B9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RbfaQ6P3B9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RbfaQ6P3B9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RbfaQ6P3B9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RbfaQ6P3B9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RbfaQ6P3B9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RbfaQ6P3B9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RbfaQ6P3B9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RbfaQ6P3B9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RbfaQ6P3B9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RbfaQ6P3B9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RbfaQ6P3B9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RbfaQ6P3B9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RbfaQ6P3B9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RbfaQ6P3B9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RbfaQ6P3B9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RbfaQ6P3B9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RbfaQ6P3B9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RbfaQ6P3B9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RbfaQ6P3B9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RbfaQ6P3B9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RbfaQ6P3B9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RbfaQ6P3B9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RbfaQ6P3B9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RbfaQ6P3B9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RbfaQ6P3B9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RbfaQ6P3B9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RbfaQ6P3B9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RbfaQ6P3B9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RbfaQ6P3B9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RbfaQ6P3B9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RbfaQ6P3B9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RbfaQ6P3B9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RbfaQ6P3B9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RbfaQ6P3B9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RbfaQ6P3B9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RbfaQ6P3B9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RbfaQ6P3B9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RbfaQ6P3B9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RbfaQ6P3B9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RbfaQ6P3B9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RbfaQ6P3B9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RbfaQ6P3B9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RbfaQ6P3B9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RbfaQ6P3B9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RbfaQ6P3B9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RbfaQ6P3B9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RbfaQ6P3B9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RbfaQ6P3B9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RbfaQ6P3B9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RbfaQ6P3B9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RbfaQ6P3B9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RbfaQ6P3B9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RbfaQ6P3B9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RbfaQ6P3B9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RbfaQ6P3B9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms