Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hdac4Q6NZM9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac4Q6NZM9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac4Q6NZM9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac4Q6NZM9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac4Q6NZM9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hdac4Q6NZM9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Hdac4Q6NZM9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hdac4Q6NZM9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hdac4Q6NZM9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac4Q6NZM9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac4Q6NZM9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac4Q6NZM9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hdac4Q6NZM9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hdac4Q6NZM9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hdac4Q6NZM9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac4Q6NZM9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hdac4Q6NZM9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hdac4Q6NZM9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hdac4Q6NZM9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hdac4Q6NZM9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Hdac4Q6NZM9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hdac4Q6NZM9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hdac4Q6NZM9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hdac4Q6NZM9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hdac4Q6NZM9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hdac4Q6NZM9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hdac4Q6NZM9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hdac4Q6NZM9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hdac4Q6NZM9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hdac4Q6NZM9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hdac4Q6NZM9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hdac4Q6NZM9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hdac4Q6NZM9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hdac4Q6NZM9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hdac4Q6NZM9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Hdac4Q6NZM9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hdac4Q6NZM9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hdac4Q6NZM9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hdac4Q6NZM9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hdac4Q6NZM9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hdac4Q6NZM9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms