Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2810408A11RikQ6NSU2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
2810408A11RikQ6NSU2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms