Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retreg2Q6NS82 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retreg2Q6NS82 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retreg2Q6NS82 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retreg2Q6NS82 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retreg2Q6NS82 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retreg2Q6NS82 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retreg2Q6NS82 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retreg2Q6NS82 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms