Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CltbQ6IRU5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CltbQ6IRU5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltbQ6IRU5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CltbQ6IRU5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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