Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nop58Q6DFW4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Nop58Q6DFW4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nop58Q6DFW4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nop58Q6DFW4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nop58Q6DFW4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms