Protein–RNA interactions for Protein: Q6A051

Atrnl1, Attractin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atrnl1Q6A051 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atrnl1Q6A051 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Atrnl1Q6A051 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Atrnl1Q6A051 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atrnl1Q6A051 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atrnl1Q6A051 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atrnl1Q6A051 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atrnl1Q6A051 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Atrnl1Q6A051 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atrnl1Q6A051 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atrnl1Q6A051 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atrnl1Q6A051 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Atrnl1Q6A051 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atrnl1Q6A051 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Atrnl1Q6A051 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atrnl1Q6A051 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atrnl1Q6A051 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Atrnl1Q6A051 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atrnl1Q6A051 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atrnl1Q6A051 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atrnl1Q6A051 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atrnl1Q6A051 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atrnl1Q6A051 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atrnl1Q6A051 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atrnl1Q6A051 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atrnl1Q6A051 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atrnl1Q6A051 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms