Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Thsd7aQ69ZU6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Thsd7aQ69ZU6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Thsd7aQ69ZU6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Thsd7aQ69ZU6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Thsd7aQ69ZU6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Thsd7aQ69ZU6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Thsd7aQ69ZU6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Thsd7aQ69ZU6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Thsd7aQ69ZU6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Thsd7aQ69ZU6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Thsd7aQ69ZU6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Thsd7aQ69ZU6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Thsd7aQ69ZU6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Thsd7aQ69ZU6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Thsd7aQ69ZU6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
Thsd7aQ69ZU6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
Thsd7aQ69ZU6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Thsd7aQ69ZU6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Thsd7aQ69ZU6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Thsd7aQ69ZU6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Thsd7aQ69ZU6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Thsd7aQ69ZU6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Thsd7aQ69ZU6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Thsd7aQ69ZU6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Thsd7aQ69ZU6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Thsd7aQ69ZU6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Thsd7aQ69ZU6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Thsd7aQ69ZU6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Thsd7aQ69ZU6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Thsd7aQ69ZU6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Thsd7aQ69ZU6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Thsd7aQ69ZU6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Thsd7aQ69ZU6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Thsd7aQ69ZU6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Thsd7aQ69ZU6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Thsd7aQ69ZU6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Thsd7aQ69ZU6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Thsd7aQ69ZU6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Thsd7aQ69ZU6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Thsd7aQ69ZU6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Thsd7aQ69ZU6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Thsd7aQ69ZU6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Thsd7aQ69ZU6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Thsd7aQ69ZU6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Thsd7aQ69ZU6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Thsd7aQ69ZU6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Thsd7aQ69ZU6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Thsd7aQ69ZU6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Thsd7aQ69ZU6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Thsd7aQ69ZU6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Thsd7aQ69ZU6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Thsd7aQ69ZU6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Thsd7aQ69ZU6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Thsd7aQ69ZU6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Thsd7aQ69ZU6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Thsd7aQ69ZU6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Thsd7aQ69ZU6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Thsd7aQ69ZU6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Thsd7aQ69ZU6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Thsd7aQ69ZU6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Thsd7aQ69ZU6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Thsd7aQ69ZU6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Thsd7aQ69ZU6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Thsd7aQ69ZU6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Thsd7aQ69ZU6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Thsd7aQ69ZU6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Thsd7aQ69ZU6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Thsd7aQ69ZU6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Thsd7aQ69ZU6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Thsd7aQ69ZU6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Thsd7aQ69ZU6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Thsd7aQ69ZU6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Thsd7aQ69ZU6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Thsd7aQ69ZU6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Thsd7aQ69ZU6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Thsd7aQ69ZU6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Thsd7aQ69ZU6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Thsd7aQ69ZU6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Thsd7aQ69ZU6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Thsd7aQ69ZU6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Thsd7aQ69ZU6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms