Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Fgd6Q69ZL1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Fgd6Q69ZL1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Fgd6Q69ZL1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Fgd6Q69ZL1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Fgd6Q69ZL1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Fgd6Q69ZL1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Fgd6Q69ZL1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Fgd6Q69ZL1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Fgd6Q69ZL1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Fgd6Q69ZL1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Fgd6Q69ZL1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Fgd6Q69ZL1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Fgd6Q69ZL1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Fgd6Q69ZL1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Fgd6Q69ZL1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Fgd6Q69ZL1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Fgd6Q69ZL1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Fgd6Q69ZL1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Fgd6Q69ZL1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Fgd6Q69ZL1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Fgd6Q69ZL1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Fgd6Q69ZL1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Fgd6Q69ZL1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Fgd6Q69ZL1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Fgd6Q69ZL1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Fgd6Q69ZL1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Fgd6Q69ZL1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Fgd6Q69ZL1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Fgd6Q69ZL1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Fgd6Q69ZL1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Fgd6Q69ZL1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Fgd6Q69ZL1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Fgd6Q69ZL1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Fgd6Q69ZL1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Fgd6Q69ZL1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Fgd6Q69ZL1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Fgd6Q69ZL1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Fgd6Q69ZL1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Fgd6Q69ZL1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Fgd6Q69ZL1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Fgd6Q69ZL1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Fgd6Q69ZL1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Fgd6Q69ZL1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Fgd6Q69ZL1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Fgd6Q69ZL1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Fgd6Q69ZL1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Fgd6Q69ZL1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Fgd6Q69ZL1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Fgd6Q69ZL1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Fgd6Q69ZL1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Fgd6Q69ZL1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Fgd6Q69ZL1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Fgd6Q69ZL1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Fgd6Q69ZL1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Fgd6Q69ZL1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Fgd6Q69ZL1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Fgd6Q69ZL1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Fgd6Q69ZL1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Fgd6Q69ZL1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Fgd6Q69ZL1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Fgd6Q69ZL1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Fgd6Q69ZL1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Fgd6Q69ZL1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Fgd6Q69ZL1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Fgd6Q69ZL1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Fgd6Q69ZL1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1238.1 ms