Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF6

Git1, ARF GTPase-activating protein GIT1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Git1Q68FF6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Git1Q68FF6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Git1Q68FF6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Git1Q68FF6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Git1Q68FF6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Git1Q68FF6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Git1Q68FF6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Git1Q68FF6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Git1Q68FF6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Git1Q68FF6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Git1Q68FF6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Git1Q68FF6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Git1Q68FF6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Git1Q68FF6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Git1Q68FF6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Git1Q68FF6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Git1Q68FF6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Git1Q68FF6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Git1Q68FF6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Git1Q68FF6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Git1Q68FF6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Git1Q68FF6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Git1Q68FF6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Git1Q68FF6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Git1Q68FF6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Git1Q68FF6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Git1Q68FF6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Git1Q68FF6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Git1Q68FF6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Git1Q68FF6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Git1Q68FF6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Git1Q68FF6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Git1Q68FF6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Git1Q68FF6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms