Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf280dQ68FE8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Znf280dQ68FE8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf280dQ68FE8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf280dQ68FE8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf280dQ68FE8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf280dQ68FE8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf280dQ68FE8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf280dQ68FE8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf280dQ68FE8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf280dQ68FE8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf280dQ68FE8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf280dQ68FE8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf280dQ68FE8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf280dQ68FE8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf280dQ68FE8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf280dQ68FE8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms