Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3ipQ68EF0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3ipQ68EF0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab3ipQ68EF0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab3ipQ68EF0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms