Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80dQ66JY2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ino80dQ66JY2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ino80dQ66JY2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ino80dQ66JY2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ino80dQ66JY2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms