Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Top2bQ64511 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Top2bQ64511 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Top2bQ64511 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Top2bQ64511 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Top2bQ64511 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Top2bQ64511 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Top2bQ64511 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
Top2bQ64511 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Top2bQ64511 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Top2bQ64511 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Top2bQ64511 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Top2bQ64511 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
Top2bQ64511 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Top2bQ64511 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Top2bQ64511 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Top2bQ64511 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Top2bQ64511 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Top2bQ64511 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Top2bQ64511 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Top2bQ64511 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Top2bQ64511 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Top2bQ64511 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Top2bQ64511 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Top2bQ64511 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Top2bQ64511 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Top2bQ64511 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Top2bQ64511 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Top2bQ64511 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Top2bQ64511 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Top2bQ64511 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Top2bQ64511 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Top2bQ64511 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Top2bQ64511 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Top2bQ64511 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Top2bQ64511 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
Top2bQ64511 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Top2bQ64511 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Top2bQ64511 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Top2bQ64511 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Top2bQ64511 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Top2bQ64511 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
Top2bQ64511 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
Top2bQ64511 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Top2bQ64511 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Top2bQ64511 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Top2bQ64511 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Top2bQ64511 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Top2bQ64511 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Top2bQ64511 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
Top2bQ64511 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Top2bQ64511 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Top2bQ64511 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Top2bQ64511 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Top2bQ64511 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Top2bQ64511 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Top2bQ64511 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Top2bQ64511 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
Top2bQ64511 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Top2bQ64511 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
Top2bQ64511 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Top2bQ64511 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Top2bQ64511 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Top2bQ64511 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Top2bQ64511 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Top2bQ64511 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Top2bQ64511 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Top2bQ64511 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Top2bQ64511 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Top2bQ64511 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Top2bQ64511 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Top2bQ64511 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
Top2bQ64511 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Top2bQ64511 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
Top2bQ64511 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Top2bQ64511 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Top2bQ64511 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Top2bQ64511 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Top2bQ64511 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
Top2bQ64511 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Top2bQ64511 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
Top2bQ64511 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC40■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms