Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf1Q64213 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sf1Q64213 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf1Q64213 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf1Q64213 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf1Q64213 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf1Q64213 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf1Q64213 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf1Q64213 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf1Q64213 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf1Q64213 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf1Q64213 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf1Q64213 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf1Q64213 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf1Q64213 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf1Q64213 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf1Q64213 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms