Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScxQ64124 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScxQ64124 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScxQ64124 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScxQ64124 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScxQ64124 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ScxQ64124 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScxQ64124 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScxQ64124 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScxQ64124 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScxQ64124 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScxQ64124 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScxQ64124 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms