Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pan3Q640Q5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pan3Q640Q5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pan3Q640Q5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms