Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab34Q64008 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab34Q64008 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab34Q64008 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab34Q64008 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab34Q64008 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab34Q64008 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab34Q64008 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab34Q64008 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab34Q64008 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab34Q64008 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab34Q64008 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab34Q64008 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab34Q64008 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab34Q64008 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab34Q64008 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab34Q64008 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab34Q64008 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms