Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Kdm5dQ62240 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Kdm5dQ62240 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC46.3■■■■■ 5
Kdm5dQ62240 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Kdm5dQ62240 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Kdm5dQ62240 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
Kdm5dQ62240 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC46.28■■■■■ 5
Kdm5dQ62240 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Kdm5dQ62240 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Kdm5dQ62240 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 5
Kdm5dQ62240 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
Kdm5dQ62240 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC46.23■■■■■ 4.99
Kdm5dQ62240 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC46.23■■■■■ 4.99
Kdm5dQ62240 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC46.23■■■■■ 4.99
Kdm5dQ62240 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Kdm5dQ62240 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Kdm5dQ62240 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
Kdm5dQ62240 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
Kdm5dQ62240 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
Kdm5dQ62240 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
Kdm5dQ62240 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC46.15■■■■■ 4.98
Kdm5dQ62240 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Kdm5dQ62240 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
Kdm5dQ62240 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.14■■■■■ 4.98
Kdm5dQ62240 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
Kdm5dQ62240 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
Kdm5dQ62240 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
Kdm5dQ62240 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
Kdm5dQ62240 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.12■■■■■ 4.97
Kdm5dQ62240 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC46.12■■■■■ 4.97
Kdm5dQ62240 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
Kdm5dQ62240 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
Kdm5dQ62240 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
Kdm5dQ62240 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
Kdm5dQ62240 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Kdm5dQ62240 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC46.07■■■■■ 4.97
Kdm5dQ62240 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC46.06■■■■■ 4.96
Kdm5dQ62240 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
Kdm5dQ62240 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
Kdm5dQ62240 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Kdm5dQ62240 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Kdm5dQ62240 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Kdm5dQ62240 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Kdm5dQ62240 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Kdm5dQ62240 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
Kdm5dQ62240 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
Kdm5dQ62240 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
Kdm5dQ62240 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
Kdm5dQ62240 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
Kdm5dQ62240 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC45.97■■■■■ 4.95
Kdm5dQ62240 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
Kdm5dQ62240 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC45.95■■■■■ 4.95
Kdm5dQ62240 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
Kdm5dQ62240 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
Kdm5dQ62240 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.93■■■■■ 4.94
Kdm5dQ62240 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC45.93■■■■■ 4.94
Kdm5dQ62240 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Kdm5dQ62240 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
Kdm5dQ62240 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
Kdm5dQ62240 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Kdm5dQ62240 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
Kdm5dQ62240 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
Kdm5dQ62240 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
Kdm5dQ62240 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Kdm5dQ62240 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Kdm5dQ62240 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
Kdm5dQ62240 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
Kdm5dQ62240 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC45.82■■■■■ 4.92
Kdm5dQ62240 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Kdm5dQ62240 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Kdm5dQ62240 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Kdm5dQ62240 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
Kdm5dQ62240 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Kdm5dQ62240 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
Kdm5dQ62240 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC45.79■■■■■ 4.92
Kdm5dQ62240 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
Kdm5dQ62240 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
Kdm5dQ62240 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
Kdm5dQ62240 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
Kdm5dQ62240 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
Kdm5dQ62240 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Kdm5dQ62240 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
Kdm5dQ62240 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Kdm5dQ62240 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Kdm5dQ62240 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Kdm5dQ62240 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Kdm5dQ62240 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
Kdm5dQ62240 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Kdm5dQ62240 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
Kdm5dQ62240 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
Kdm5dQ62240 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
Kdm5dQ62240 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
Kdm5dQ62240 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
Kdm5dQ62240 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
Kdm5dQ62240 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Kdm5dQ62240 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
Kdm5dQ62240 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC45.67■■■■■ 4.9
Kdm5dQ62240 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
Kdm5dQ62240 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC45.67■■■■■ 4.9
Kdm5dQ62240 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms