Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3bQ62177 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3bQ62177 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3bQ62177 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema3bQ62177 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms