Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RhocQ62159 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RhocQ62159 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RhocQ62159 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RhocQ62159 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RhocQ62159 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RhocQ62159 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RhocQ62159 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RhocQ62159 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RhocQ62159 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RhocQ62159 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RhocQ62159 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RhocQ62159 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RhocQ62159 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RhocQ62159 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RhocQ62159 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RhocQ62159 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RhocQ62159 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RhocQ62159 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RhocQ62159 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RhocQ62159 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RhocQ62159 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RhocQ62159 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RhocQ62159 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RhocQ62159 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RhocQ62159 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RhocQ62159 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RhocQ62159 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RhocQ62159 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RhocQ62159 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RhocQ62159 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RhocQ62159 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RhocQ62159 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RhocQ62159 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RhocQ62159 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RhocQ62159 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RhocQ62159 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RhocQ62159 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RhocQ62159 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RhocQ62159 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RhocQ62159 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RhocQ62159 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RhocQ62159 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RhocQ62159 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RhocQ62159 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RhocQ62159 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RhocQ62159 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RhocQ62159 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RhocQ62159 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RhocQ62159 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RhocQ62159 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RhocQ62159 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RhocQ62159 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RhocQ62159 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RhocQ62159 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RhocQ62159 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RhocQ62159 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RhocQ62159 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RhocQ62159 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RhocQ62159 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RhocQ62159 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RhocQ62159 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RhocQ62159 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RhocQ62159 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms