Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifi47Q61635 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifi47Q61635 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifi47Q61635 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifi47Q61635 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifi47Q61635 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifi47Q61635 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifi47Q61635 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifi47Q61635 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifi47Q61635 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifi47Q61635 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifi47Q61635 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifi47Q61635 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifi47Q61635 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifi47Q61635 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifi47Q61635 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifi47Q61635 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifi47Q61635 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifi47Q61635 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifi47Q61635 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifi47Q61635 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifi47Q61635 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifi47Q61635 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms