Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MslnQ61468 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MslnQ61468 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MslnQ61468 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MslnQ61468 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MslnQ61468 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MslnQ61468 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MslnQ61468 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MslnQ61468 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MslnQ61468 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MslnQ61468 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms