Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnna2Q61301 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnna2Q61301 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna2Q61301 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna2Q61301 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna2Q61301 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctnna2Q61301 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctnna2Q61301 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctnna2Q61301 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnna2Q61301 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctnna2Q61301 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctnna2Q61301 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnna2Q61301 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnna2Q61301 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnna2Q61301 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctnna2Q61301 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctnna2Q61301 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnna2Q61301 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnna2Q61301 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnna2Q61301 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnna2Q61301 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnna2Q61301 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnna2Q61301 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna2Q61301 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna2Q61301 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna2Q61301 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna2Q61301 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctnna2Q61301 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnna2Q61301 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnna2Q61301 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnna2Q61301 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnna2Q61301 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnna2Q61301 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnna2Q61301 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnna2Q61301 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnna2Q61301 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnna2Q61301 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnna2Q61301 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnna2Q61301 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna2Q61301 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms