Protein–RNA interactions for Protein: Q61241

Tssk1b, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk1bQ61241 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk1bQ61241 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms