Protein–RNA interactions for Protein: Q61241

Tssk1b, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk1bQ61241 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tssk1bQ61241 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tssk1bQ61241 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk1bQ61241 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk1bQ61241 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk1bQ61241 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms