Protein–RNA interactions for Protein: Q61147

Cp, Ceruloplasmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpQ61147 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CpQ61147 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CpQ61147 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CpQ61147 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CpQ61147 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CpQ61147 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CpQ61147 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CpQ61147 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CpQ61147 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CpQ61147 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CpQ61147 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CpQ61147 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CpQ61147 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CpQ61147 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CpQ61147 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CpQ61147 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CpQ61147 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CpQ61147 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CpQ61147 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CpQ61147 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CpQ61147 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CpQ61147 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CpQ61147 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CpQ61147 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CpQ61147 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CpQ61147 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CpQ61147 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CpQ61147 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CpQ61147 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CpQ61147 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CpQ61147 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CpQ61147 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CpQ61147 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CpQ61147 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CpQ61147 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CpQ61147 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CpQ61147 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CpQ61147 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CpQ61147 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CpQ61147 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CpQ61147 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CpQ61147 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CpQ61147 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CpQ61147 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CpQ61147 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CpQ61147 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CpQ61147 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CpQ61147 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CpQ61147 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CpQ61147 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CpQ61147 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CpQ61147 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CpQ61147 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CpQ61147 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CpQ61147 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CpQ61147 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CpQ61147 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CpQ61147 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CpQ61147 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CpQ61147 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CpQ61147 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CpQ61147 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpQ61147 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpQ61147 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpQ61147 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CpQ61147 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpQ61147 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpQ61147 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpQ61147 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpQ61147 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CpQ61147 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpQ61147 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpQ61147 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpQ61147 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpQ61147 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpQ61147 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpQ61147 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpQ61147 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpQ61147 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpQ61147 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpQ61147 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CpQ61147 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CpQ61147 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CpQ61147 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CpQ61147 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CpQ61147 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CpQ61147 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CpQ61147 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CpQ61147 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CpQ61147 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CpQ61147 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CpQ61147 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CpQ61147 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CpQ61147 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CpQ61147 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CpQ61147 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CpQ61147 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CpQ61147 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CpQ61147 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CpQ61147 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms