Protein–RNA interactions for Protein: Q60953

Pml, Protein PML, mousemouse

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmlQ60953 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PmlQ60953 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PmlQ60953 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PmlQ60953 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PmlQ60953 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PmlQ60953 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PmlQ60953 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PmlQ60953 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PmlQ60953 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PmlQ60953 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PmlQ60953 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PmlQ60953 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PmlQ60953 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PmlQ60953 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PmlQ60953 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PmlQ60953 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PmlQ60953 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PmlQ60953 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PmlQ60953 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PmlQ60953 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PmlQ60953 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PmlQ60953 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PmlQ60953 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PmlQ60953 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PmlQ60953 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PmlQ60953 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PmlQ60953 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PmlQ60953 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PmlQ60953 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PmlQ60953 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PmlQ60953 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PmlQ60953 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PmlQ60953 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PmlQ60953 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PmlQ60953 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PmlQ60953 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmlQ60953 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmlQ60953 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PmlQ60953 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PmlQ60953 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PmlQ60953 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmlQ60953 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmlQ60953 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmlQ60953 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PmlQ60953 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PmlQ60953 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PmlQ60953 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PmlQ60953 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PmlQ60953 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PmlQ60953 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmlQ60953 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PmlQ60953 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmlQ60953 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmlQ60953 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PmlQ60953 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmlQ60953 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmlQ60953 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PmlQ60953 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PmlQ60953 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PmlQ60953 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms