Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stxbp3Q60770 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stxbp3Q60770 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stxbp3Q60770 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stxbp3Q60770 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stxbp3Q60770 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stxbp3Q60770 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stxbp3Q60770 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stxbp3Q60770 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stxbp3Q60770 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stxbp3Q60770 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stxbp3Q60770 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stxbp3Q60770 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stxbp3Q60770 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stxbp3Q60770 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stxbp3Q60770 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stxbp3Q60770 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Stxbp3Q60770 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stxbp3Q60770 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Stxbp3Q60770 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stxbp3Q60770 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stxbp3Q60770 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stxbp3Q60770 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stxbp3Q60770 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stxbp3Q60770 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stxbp3Q60770 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stxbp3Q60770 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stxbp3Q60770 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Stxbp3Q60770 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stxbp3Q60770 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stxbp3Q60770 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Stxbp3Q60770 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stxbp3Q60770 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stxbp3Q60770 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stxbp3Q60770 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Stxbp3Q60770 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Stxbp3Q60770 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stxbp3Q60770 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stxbp3Q60770 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stxbp3Q60770 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Stxbp3Q60770 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stxbp3Q60770 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stxbp3Q60770 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stxbp3Q60770 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stxbp3Q60770 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stxbp3Q60770 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stxbp3Q60770 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stxbp3Q60770 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stxbp3Q60770 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Stxbp3Q60770 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stxbp3Q60770 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stxbp3Q60770 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stxbp3Q60770 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stxbp3Q60770 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stxbp3Q60770 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stxbp3Q60770 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stxbp3Q60770 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Stxbp3Q60770 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stxbp3Q60770 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stxbp3Q60770 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stxbp3Q60770 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stxbp3Q60770 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stxbp3Q60770 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stxbp3Q60770 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stxbp3Q60770 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stxbp3Q60770 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stxbp3Q60770 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stxbp3Q60770 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stxbp3Q60770 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stxbp3Q60770 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Stxbp3Q60770 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stxbp3Q60770 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stxbp3Q60770 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Stxbp3Q60770 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stxbp3Q60770 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stxbp3Q60770 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stxbp3Q60770 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stxbp3Q60770 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stxbp3Q60770 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stxbp3Q60770 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stxbp3Q60770 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stxbp3Q60770 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stxbp3Q60770 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms