Protein–RNA interactions for Protein: Q60595

Xlr3a, X-linked lymphocyte-regulated protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr3aQ60595 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr3aQ60595 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr3aQ60595 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr3aQ60595 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr3aQ60595 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xlr3aQ60595 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xlr3aQ60595 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xlr3aQ60595 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xlr3aQ60595 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xlr3aQ60595 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xlr3aQ60595 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xlr3aQ60595 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xlr3aQ60595 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xlr3aQ60595 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xlr3aQ60595 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xlr3aQ60595 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xlr3aQ60595 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xlr3aQ60595 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xlr3aQ60595 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xlr3aQ60595 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms