Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWU9

Acaca, Acetyl-CoA carboxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcacaQ5SWU9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AcacaQ5SWU9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AcacaQ5SWU9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AcacaQ5SWU9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AcacaQ5SWU9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AcacaQ5SWU9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AcacaQ5SWU9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AcacaQ5SWU9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AcacaQ5SWU9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AcacaQ5SWU9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AcacaQ5SWU9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AcacaQ5SWU9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AcacaQ5SWU9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AcacaQ5SWU9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AcacaQ5SWU9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AcacaQ5SWU9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AcacaQ5SWU9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AcacaQ5SWU9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AcacaQ5SWU9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AcacaQ5SWU9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AcacaQ5SWU9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AcacaQ5SWU9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AcacaQ5SWU9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AcacaQ5SWU9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AcacaQ5SWU9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AcacaQ5SWU9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AcacaQ5SWU9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AcacaQ5SWU9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AcacaQ5SWU9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AcacaQ5SWU9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AcacaQ5SWU9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms