Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arhgap44Q5SSM3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgap44Q5SSM3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Arhgap44Q5SSM3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap44Q5SSM3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap44Q5SSM3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgap44Q5SSM3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap44Q5SSM3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap44Q5SSM3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgap44Q5SSM3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms