Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmprss11eQ5S248 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmprss11eQ5S248 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmprss11eQ5S248 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmprss11eQ5S248 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmprss11eQ5S248 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmprss11eQ5S248 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmprss11eQ5S248 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmprss11eQ5S248 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmprss11eQ5S248 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmprss11eQ5S248 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmprss11eQ5S248 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmprss11eQ5S248 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tmprss11eQ5S248 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmprss11eQ5S248 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmprss11eQ5S248 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmprss11eQ5S248 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmprss11eQ5S248 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmprss11eQ5S248 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmprss11eQ5S248 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmprss11eQ5S248 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmprss11eQ5S248 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmprss11eQ5S248 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmprss11eQ5S248 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmprss11eQ5S248 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmprss11eQ5S248 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmprss11eQ5S248 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmprss11eQ5S248 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmprss11eQ5S248 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmprss11eQ5S248 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tmprss11eQ5S248 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmprss11eQ5S248 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmprss11eQ5S248 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmprss11eQ5S248 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmprss11eQ5S248 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmprss11eQ5S248 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmprss11eQ5S248 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmprss11eQ5S248 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmprss11eQ5S248 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmprss11eQ5S248 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmprss11eQ5S248 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmprss11eQ5S248 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmprss11eQ5S248 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tmprss11eQ5S248 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Tmprss11eQ5S248 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms