Protein–RNA interactions for Protein: Q5PT54

Slc10a5, Sodium/bile acid cotransporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a5Q5PT54 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc10a5Q5PT54 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc10a5Q5PT54 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc10a5Q5PT54 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc10a5Q5PT54 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc10a5Q5PT54 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc10a5Q5PT54 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc10a5Q5PT54 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc10a5Q5PT54 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc10a5Q5PT54 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc10a5Q5PT54 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc10a5Q5PT54 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc10a5Q5PT54 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Slc10a5Q5PT54 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc10a5Q5PT54 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc10a5Q5PT54 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc10a5Q5PT54 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc10a5Q5PT54 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc10a5Q5PT54 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Slc10a5Q5PT54 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slc10a5Q5PT54 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc10a5Q5PT54 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc10a5Q5PT54 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc10a5Q5PT54 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc10a5Q5PT54 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc10a5Q5PT54 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc10a5Q5PT54 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc10a5Q5PT54 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc10a5Q5PT54 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc10a5Q5PT54 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc10a5Q5PT54 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Slc10a5Q5PT54 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Slc10a5Q5PT54 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slc10a5Q5PT54 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc10a5Q5PT54 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc10a5Q5PT54 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc10a5Q5PT54 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc10a5Q5PT54 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc10a5Q5PT54 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc10a5Q5PT54 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc10a5Q5PT54 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc10a5Q5PT54 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Slc10a5Q5PT54 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slc10a5Q5PT54 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms