Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCQ5

Dph1, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph1Q5NCQ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dph1Q5NCQ5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dph1Q5NCQ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Dph1Q5NCQ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dph1Q5NCQ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dph1Q5NCQ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dph1Q5NCQ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dph1Q5NCQ5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dph1Q5NCQ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dph1Q5NCQ5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Dph1Q5NCQ5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Dph1Q5NCQ5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dph1Q5NCQ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dph1Q5NCQ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Dph1Q5NCQ5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dph1Q5NCQ5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Dph1Q5NCQ5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dph1Q5NCQ5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dph1Q5NCQ5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dph1Q5NCQ5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dph1Q5NCQ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dph1Q5NCQ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dph1Q5NCQ5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dph1Q5NCQ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dph1Q5NCQ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dph1Q5NCQ5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dph1Q5NCQ5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dph1Q5NCQ5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dph1Q5NCQ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dph1Q5NCQ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dph1Q5NCQ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dph1Q5NCQ5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dph1Q5NCQ5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dph1Q5NCQ5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dph1Q5NCQ5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dph1Q5NCQ5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dph1Q5NCQ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dph1Q5NCQ5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dph1Q5NCQ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dph1Q5NCQ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dph1Q5NCQ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dph1Q5NCQ5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dph1Q5NCQ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dph1Q5NCQ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dph1Q5NCQ5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dph1Q5NCQ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dph1Q5NCQ5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dph1Q5NCQ5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dph1Q5NCQ5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dph1Q5NCQ5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dph1Q5NCQ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dph1Q5NCQ5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Dph1Q5NCQ5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dph1Q5NCQ5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dph1Q5NCQ5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dph1Q5NCQ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dph1Q5NCQ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dph1Q5NCQ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dph1Q5NCQ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dph1Q5NCQ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dph1Q5NCQ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dph1Q5NCQ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dph1Q5NCQ5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dph1Q5NCQ5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dph1Q5NCQ5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dph1Q5NCQ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dph1Q5NCQ5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dph1Q5NCQ5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Dph1Q5NCQ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dph1Q5NCQ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dph1Q5NCQ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Dph1Q5NCQ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dph1Q5NCQ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dph1Q5NCQ5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dph1Q5NCQ5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Dph1Q5NCQ5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dph1Q5NCQ5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dph1Q5NCQ5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms