Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rapgef6Q5NCJ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rapgef6Q5NCJ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rapgef6Q5NCJ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rapgef6Q5NCJ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rapgef6Q5NCJ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rapgef6Q5NCJ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rapgef6Q5NCJ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rapgef6Q5NCJ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rapgef6Q5NCJ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rapgef6Q5NCJ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Rapgef6Q5NCJ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rapgef6Q5NCJ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rapgef6Q5NCJ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rapgef6Q5NCJ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rapgef6Q5NCJ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rapgef6Q5NCJ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Rapgef6Q5NCJ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rapgef6Q5NCJ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rapgef6Q5NCJ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Rapgef6Q5NCJ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Rapgef6Q5NCJ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rapgef6Q5NCJ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rapgef6Q5NCJ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rapgef6Q5NCJ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rapgef6Q5NCJ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Rapgef6Q5NCJ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Rapgef6Q5NCJ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Rapgef6Q5NCJ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rapgef6Q5NCJ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rapgef6Q5NCJ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rapgef6Q5NCJ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rapgef6Q5NCJ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rapgef6Q5NCJ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rapgef6Q5NCJ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rapgef6Q5NCJ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rapgef6Q5NCJ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rapgef6Q5NCJ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rapgef6Q5NCJ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rapgef6Q5NCJ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rapgef6Q5NCJ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rapgef6Q5NCJ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rapgef6Q5NCJ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rapgef6Q5NCJ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rapgef6Q5NCJ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rapgef6Q5NCJ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rapgef6Q5NCJ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rapgef6Q5NCJ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rapgef6Q5NCJ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Rapgef6Q5NCJ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rapgef6Q5NCJ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rapgef6Q5NCJ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rapgef6Q5NCJ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rapgef6Q5NCJ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rapgef6Q5NCJ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rapgef6Q5NCJ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rapgef6Q5NCJ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rapgef6Q5NCJ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rapgef6Q5NCJ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms