Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clhc1Q5M6W3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clhc1Q5M6W3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clhc1Q5M6W3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clhc1Q5M6W3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clhc1Q5M6W3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clhc1Q5M6W3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clhc1Q5M6W3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clhc1Q5M6W3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clhc1Q5M6W3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clhc1Q5M6W3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clhc1Q5M6W3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clhc1Q5M6W3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clhc1Q5M6W3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clhc1Q5M6W3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clhc1Q5M6W3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clhc1Q5M6W3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms