Protein–RNA interactions for Protein: Q5ISE2

Zfp36l3, mRNA decay activator protein ZFP36L3, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l3Q5ISE2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp36l3Q5ISE2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp36l3Q5ISE2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp36l3Q5ISE2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp36l3Q5ISE2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp36l3Q5ISE2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp36l3Q5ISE2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp36l3Q5ISE2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp36l3Q5ISE2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp36l3Q5ISE2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp36l3Q5ISE2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp36l3Q5ISE2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp36l3Q5ISE2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp36l3Q5ISE2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp36l3Q5ISE2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp36l3Q5ISE2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp36l3Q5ISE2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp36l3Q5ISE2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp36l3Q5ISE2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp36l3Q5ISE2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp36l3Q5ISE2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp36l3Q5ISE2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp36l3Q5ISE2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp36l3Q5ISE2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms